Томас Андерсон, известный также под именем Нео, обычный программист, обнаруживает, что мир, в котором он живет, на самом деле является виртуальной реальностью, созданной машинами для контроля над человечеством. Он присоединяется к группе сопротивления и узнает о своей роли в предсказанной пророчеством борьбе против машин. Нео осознает свою силу, вступает в виртуальные сражения и становится Избранным - единственным, кто может спасти человечество от рабства в Матрице.